MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022784	CTGC	2	8	299722	299729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_022784	AGT	2	6	299755	299760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_022784	TC	3	6	299820	299825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_022784	T	6	6	299867	299872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_022784	CAG	2	6	299943	299948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_022784	TGGTG	2	10	299962	299971	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_022784	TG	4	8	299981	299988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_022784	TTA	2	6	299998	300003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_022784	TGCA	2	8	300078	300085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_022784	GCT	2	6	300137	300142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_022784	TTG	2	6	300156	300161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_022784	CTG	2	6	300175	300180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_022784	CTTG	2	8	300204	300211	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5514	NC_022784	TAA	2	6	300218	300223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_022784	TGT	2	6	300293	300298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_022784	TCC	2	6	300304	300309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_022784	AGA	2	6	300363	300368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_022784	CAA	2	6	300383	300388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_022784	ATT	2	6	300406	300411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_022784	GTT	2	6	300429	300434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_022784	TGA	2	6	300458	300463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_022784	TTC	2	6	300465	300470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_022784	ACC	2	6	300534	300539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_022784	A	6	6	300540	300545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_022784	GCT	2	6	300563	300568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_022784	TGTC	2	8	300770	300777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5527	NC_022784	CGATC	2	10	300822	300831	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5528	NC_022784	CT	3	6	300901	300906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_022784	TGT	2	6	300988	300993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_022784	CTG	3	9	300999	301007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_022784	GCC	2	6	301021	301026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_022784	TTG	2	6	301038	301043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_022784	CGCC	2	8	301126	301133	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5534	NC_022784	CAG	2	6	301137	301142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_022784	AAC	2	6	301152	301157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_022784	CG	3	6	301196	301201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_022784	AGC	2	6	301215	301220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_022784	CATG	2	8	301261	301268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_022784	CGG	2	6	301282	301287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_022784	TGT	2	6	301314	301319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_022784	GC	3	6	301329	301334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_022784	CGC	3	9	301342	301350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_022784	CAG	2	6	301369	301374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_022784	CCA	2	6	301404	301409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625513
5545	NC_022784	GGCCT	2	10	301417	301426	0 %	20 %	40 %	40 %	557625513
5546	NC_022784	CTG	2	6	301479	301484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5547	NC_022784	TGAT	2	8	301523	301530	25 %	50 %	25 %	0 %	557625513
5548	NC_022784	CAT	2	6	301537	301542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625513
5549	NC_022784	CATATA	2	12	301642	301653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	557625513
5550	NC_022784	CCAAG	2	10	301724	301733	40 %	0 %	20 %	40 %	557625513
5551	NC_022784	CATC	2	8	301819	301826	25 %	25 %	0 %	50 %	557625513
5552	NC_022784	CGT	2	6	301827	301832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5553	NC_022784	TCA	2	6	301857	301862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625513
5554	NC_022784	GCT	2	6	301877	301882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5555	NC_022784	CCA	2	6	301890	301895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625513
5556	NC_022784	GCC	2	6	301899	301904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625513
5557	NC_022784	TC	3	6	301940	301945	0 %	50 %	0 %	50 %	557625513
5558	NC_022784	CCT	2	6	301946	301951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625513
5559	NC_022784	TTG	2	6	301960	301965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625513
5560	NC_022784	GTGCT	2	10	302145	302154	0 %	40 %	40 %	20 %	557625513
5561	NC_022784	TTC	2	6	302183	302188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625513
5562	NC_022784	TCT	2	6	302232	302237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625513
5563	NC_022784	AGA	2	6	302267	302272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625513
5564	NC_022784	ACC	2	6	302273	302278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625513
5565	NC_022784	CTG	2	6	302302	302307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5566	NC_022784	AAC	2	6	302321	302326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625513
5567	NC_022784	CCT	2	6	302332	302337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625513
5568	NC_022784	CTT	2	6	302392	302397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625513
5569	NC_022784	TACT	2	8	302524	302531	25 %	50 %	0 %	25 %	557625513
5570	NC_022784	A	6	6	302556	302561	100 %	0 %	0 %	0 %	557625513
5571	NC_022784	ACG	2	6	302637	302642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5572	NC_022784	G	6	6	302697	302702	0 %	0 %	100 %	0 %	557625513
5573	NC_022784	TCC	2	6	302733	302738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625513
5574	NC_022784	CT	3	6	302747	302752	0 %	50 %	0 %	50 %	557625513
5575	NC_022784	GTC	2	6	302753	302758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5576	NC_022784	AGA	2	6	302785	302790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625513
5577	NC_022784	GCA	2	6	302850	302855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5578	NC_022784	ATG	2	6	302991	302996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625513
5579	NC_022784	T	6	6	303007	303012	0 %	100 %	0 %	0 %	557625513
5580	NC_022784	GACT	2	8	303017	303024	25 %	25 %	25 %	25 %	557625513
5581	NC_022784	GCA	2	6	303237	303242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5582	NC_022784	TG	3	6	303249	303254	0 %	50 %	50 %	0 %	557625513
5583	NC_022784	GCT	2	6	303262	303267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5584	NC_022784	ACC	2	6	303309	303314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625513
5585	NC_022784	TCTG	2	8	303327	303334	0 %	50 %	25 %	25 %	557625513
5586	NC_022784	CCA	2	6	303335	303340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625513
5587	NC_022784	TGC	2	6	303363	303368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5588	NC_022784	CTT	2	6	303434	303439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625513
5589	NC_022784	AGC	2	6	303449	303454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5590	NC_022784	TGG	2	6	303570	303575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625513
5591	NC_022784	GAT	2	6	303684	303689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625513
5592	NC_022784	CTGCC	2	10	303700	303709	0 %	20 %	20 %	60 %	557625513
5593	NC_022784	GCG	2	6	303710	303715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625513
5594	NC_022784	ACG	2	6	303726	303731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5595	NC_022784	ATG	2	6	303804	303809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625513
5596	NC_022784	TGC	2	6	303863	303868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5597	NC_022784	ACC	2	6	303900	303905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625513
5598	NC_022784	ACC	2	6	303918	303923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625513
5599	NC_022784	GT	3	6	304045	304050	0 %	50 %	50 %	0 %	557625513
5600	NC_022784	TGC	2	6	304096	304101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5601	NC_022784	CAA	2	6	304178	304183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625513
5602	NC_022784	T	7	7	304199	304205	0 %	100 %	0 %	0 %	557625513
5603	NC_022784	TAC	2	6	304351	304356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625513
5604	NC_022784	TGAC	2	8	304449	304456	25 %	25 %	25 %	25 %	557625513
5605	NC_022784	TCC	2	6	304542	304547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625513
5606	NC_022784	TCT	2	6	304554	304559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625513
5607	NC_022784	CAC	2	6	304569	304574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625513
5608	NC_022784	GCT	2	6	304583	304588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5609	NC_022784	TTTGC	2	10	304612	304621	0 %	60 %	20 %	20 %	557625513
5610	NC_022784	GCA	2	6	304656	304661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5611	NC_022784	CG	3	6	304691	304696	0 %	0 %	50 %	50 %	557625513
5612	NC_022784	AAC	2	6	304752	304757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625513
5613	NC_022784	CTA	2	6	304777	304782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625513
5614	NC_022784	GCAT	2	8	304875	304882	25 %	25 %	25 %	25 %	557625513
5615	NC_022784	TGC	2	6	304932	304937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5616	NC_022784	TGG	2	6	304951	304956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625513
5617	NC_022784	AAG	2	6	305051	305056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625513
5618	NC_022784	GCG	2	6	305091	305096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625513
5619	NC_022784	GCT	2	6	305126	305131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5620	NC_022784	GCT	3	9	305187	305195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5621	NC_022784	GGC	2	6	305196	305201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625513
5622	NC_022784	TGC	2	6	305222	305227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
5623	NC_022784	CATC	2	8	305308	305315	25 %	25 %	0 %	50 %	557625513
5624	NC_022784	ACC	2	6	305316	305321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625513
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5626	NC_022784	CT	3	6	305391	305396	0 %	50 %	0 %	50 %	557625513
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